Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apba1B2RUJ5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms