Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprbB2RU80 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms