Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NhsB1AV60 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NhsB1AV60 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms