Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn8B1ARD8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms