Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap221A9Q751 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms