Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atp8b5A3FIN4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b5A3FIN4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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