Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd1A2AKB4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms