Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csmd2V9GX34 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd2V9GX34 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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