Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn8Q9Z260 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cldn8Q9Z260 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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