Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ilf3Q9Z1X4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms