Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms