Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms