Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc3Q9R0B6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms