Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms