Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms