Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms