Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan3Q9QY33 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan3Q9QY33 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms