Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms