Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms