Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms