Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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