Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms