Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msh5Q9QUM7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms