Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CubnQ9JLB4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms