Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ybx3Q9JKB3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms