Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClpxQ9JHS4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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