Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfrsf13bQ9ET35 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms