Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms