Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms