Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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