Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms