Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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