Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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