Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms