Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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