Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl53Q9D1H8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms