Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms