Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Mms19Q9D071 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Mms19Q9D071 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mms19Q9D071 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mms19Q9D071 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mms19Q9D071 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mms19Q9D071 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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