Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms