Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmed5Q9CXE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms