Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms