Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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