Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms