Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med4Q9CQA5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms