Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms