Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg3Q9CPX6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms