Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms