Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdac9Q99N13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdac9Q99N13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms