Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms