Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr3Q99MB1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr3Q99MB1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms